Plateau de Génotypage

Ce plateau est interne à l’Unité et répond aux demandes des équipes et des programmes scientifiques de l’IGEPP. On y pratique toute une gamme de techniques de biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR, RT-PCR, PCR-quantitative, clonage...) sur différents types de matrices telles que les plantes, certains microbes et ravageurs des cultures.

Les activités du plateau sont animées par Nathalie Prunier Leterme en liaison étroite avec les utilisateurs et le groupe Biologie Moléculaire de l’unité.

Contact

Nathalie.Leterme@inrae.fr

Equipement

Robot extraction ADN

• Cybi^R-Selma, tête 96 (Cybio)

Robot pour les réactions PCR

• Robot pour la distribution de l’AND et du mix : Biomek NX^P, tête  96 (Beckman Coulter)
• Robot pour la dilution de produits PCR et le multiplexage : Zephir, tête 384 (CaliperLifeSciences)

Machines PCR

• 3 Thermocycleurs C1000^tm (Biorad) : 2 blocs avec 96 puits et 1 bloc avec 384 puits
• 9 Thermocycleurs S1000^tm (Biorad) : 3 blocs de 96 puits, 5 blocs de 384 puits et 1 bloc de 2*48 puits
• 2 Thermocycleurs PTC-100 (MJ Research), bloc de 96 puits
• 1 Thermocycleur  PTC-200 (MJ Research), bloc de 2*48 puits
• 2 Thermocycleurs PTC-225  (MJ Research), 4 blocs de 384 puits et 4 blocs de 96 puits

Appareil PCR quantitative

• Un Light Cycler 480 II (Roche), blocs 96 ou 384 puits

Séquenceur ADN

• Un 3130xl Genetic Analyser (Applied Biosystems), 16 capillaires

Quantification AND, ARN

• Un spectrophotomètre PHERAstarFS (BMG LABTECH)
• Un spectrophotomètre NANODROP (LABTECH)
• Un bioanalyseur 2100 (AGILENT)